Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Kdm5dQ62240 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
Kdm5dQ62240 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Kdm5dQ62240 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Kdm5dQ62240 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Kdm5dQ62240 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Kdm5dQ62240 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Kdm5dQ62240 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Kdm5dQ62240 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Kdm5dQ62240 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Kdm5dQ62240 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Kdm5dQ62240 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Kdm5dQ62240 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Kdm5dQ62240 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Kdm5dQ62240 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC36■■■■□ 3.35
Kdm5dQ62240 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Kdm5dQ62240 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Kdm5dQ62240 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Kdm5dQ62240 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Kdm5dQ62240 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
Kdm5dQ62240 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Kdm5dQ62240 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Kdm5dQ62240 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Kdm5dQ62240 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Kdm5dQ62240 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Kdm5dQ62240 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Kdm5dQ62240 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Kdm5dQ62240 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Kdm5dQ62240 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
Kdm5dQ62240 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Kdm5dQ62240 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Kdm5dQ62240 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
Kdm5dQ62240 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Kdm5dQ62240 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Kdm5dQ62240 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Kdm5dQ62240 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Kdm5dQ62240 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Kdm5dQ62240 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Kdm5dQ62240 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Kdm5dQ62240 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Kdm5dQ62240 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Kdm5dQ62240 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Kdm5dQ62240 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Kdm5dQ62240 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Kdm5dQ62240 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Kdm5dQ62240 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Kdm5dQ62240 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Kdm5dQ62240 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Kdm5dQ62240 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Kdm5dQ62240 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Kdm5dQ62240 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
Kdm5dQ62240 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
Kdm5dQ62240 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
Kdm5dQ62240 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Kdm5dQ62240 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
Kdm5dQ62240 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Kdm5dQ62240 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Kdm5dQ62240 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Kdm5dQ62240 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Kdm5dQ62240 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
Kdm5dQ62240 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Kdm5dQ62240 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Kdm5dQ62240 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Kdm5dQ62240 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Kdm5dQ62240 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Kdm5dQ62240 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Kdm5dQ62240 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Kdm5dQ62240 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Kdm5dQ62240 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Kdm5dQ62240 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Kdm5dQ62240 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Kdm5dQ62240 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Kdm5dQ62240 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Kdm5dQ62240 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Kdm5dQ62240 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Kdm5dQ62240 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Kdm5dQ62240 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Kdm5dQ62240 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Kdm5dQ62240 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Kdm5dQ62240 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Kdm5dQ62240 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Kdm5dQ62240 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Kdm5dQ62240 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Kdm5dQ62240 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Kdm5dQ62240 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Kdm5dQ62240 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Kdm5dQ62240 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Kdm5dQ62240 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Kdm5dQ62240 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Kdm5dQ62240 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Kdm5dQ62240 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Kdm5dQ62240 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Kdm5dQ62240 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Kdm5dQ62240 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Kdm5dQ62240 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
Kdm5dQ62240 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Kdm5dQ62240 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Kdm5dQ62240 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Kdm5dQ62240 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Kdm5dQ62240 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms