Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctr9Q62018 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms