Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga7Q61738 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga7Q61738 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga7Q61738 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga7Q61738 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga7Q61738 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga7Q61738 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga7Q61738 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga7Q61738 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga7Q61738 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga7Q61738 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga7Q61738 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga7Q61738 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga7Q61738 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga7Q61738 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga7Q61738 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga7Q61738 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga7Q61738 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga7Q61738 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga7Q61738 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga7Q61738 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Itga7Q61738 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga7Q61738 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Itga7Q61738 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itga7Q61738 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itga7Q61738 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itga7Q61738 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itga7Q61738 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itga7Q61738 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itga7Q61738 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga7Q61738 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga7Q61738 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga7Q61738 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga7Q61738 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms