Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gli3Q61602 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gli3Q61602 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gli3Q61602 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gli3Q61602 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Gli3Q61602 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gli3Q61602 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gli3Q61602 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gli3Q61602 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gli3Q61602 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gli3Q61602 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gli3Q61602 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gli3Q61602 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gli3Q61602 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gli3Q61602 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gli3Q61602 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gli3Q61602 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gli3Q61602 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gli3Q61602 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gli3Q61602 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gli3Q61602 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gli3Q61602 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gli3Q61602 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gli3Q61602 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gli3Q61602 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gli3Q61602 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gli3Q61602 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gli3Q61602 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gli3Q61602 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gli3Q61602 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gli3Q61602 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gli3Q61602 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Gli3Q61602 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gli3Q61602 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gli3Q61602 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gli3Q61602 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gli3Q61602 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gli3Q61602 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Gli3Q61602 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gli3Q61602 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gli3Q61602 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gli3Q61602 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gli3Q61602 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gli3Q61602 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gli3Q61602 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gli3Q61602 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gli3Q61602 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gli3Q61602 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms