Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AcanQ61282 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AcanQ61282 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AcanQ61282 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AcanQ61282 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AcanQ61282 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AcanQ61282 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AcanQ61282 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms