Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms