Protein–RNA interactions for Protein: Q61080

Foxf1, Forkhead box protein F1, mousemouse

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxf1Q61080 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxf1Q61080 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxf1Q61080 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxf1Q61080 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxf1Q61080 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxf1Q61080 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxf1Q61080 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxf1Q61080 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxf1Q61080 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxf1Q61080 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxf1Q61080 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxf1Q61080 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxf1Q61080 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxf1Q61080 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxf1Q61080 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxf1Q61080 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxf1Q61080 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxf1Q61080 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxf1Q61080 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxf1Q61080 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxf1Q61080 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxf1Q61080 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxf1Q61080 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxf1Q61080 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxf1Q61080 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxf1Q61080 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxf1Q61080 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms