Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NinQ61043 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NinQ61043 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NinQ61043 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NinQ61043 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NinQ61043 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NinQ61043 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NinQ61043 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NinQ61043 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NinQ61043 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NinQ61043 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NinQ61043 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NinQ61043 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NinQ61043 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NinQ61043 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NinQ61043 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NinQ61043 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NinQ61043 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NinQ61043 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NinQ61043 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NinQ61043 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NinQ61043 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NinQ61043 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NinQ61043 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NinQ61043 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NinQ61043 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NinQ61043 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NinQ61043 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NinQ61043 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NinQ61043 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NinQ61043 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NinQ61043 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NinQ61043 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NinQ61043 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NinQ61043 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NinQ61043 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NinQ61043 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NinQ61043 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NinQ61043 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NinQ61043 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NinQ61043 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NinQ61043 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NinQ61043 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NinQ61043 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NinQ61043 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NinQ61043 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NinQ61043 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NinQ61043 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NinQ61043 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NinQ61043 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NinQ61043 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NinQ61043 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NinQ61043 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NinQ61043 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NinQ61043 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NinQ61043 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NinQ61043 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NinQ61043 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NinQ61043 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NinQ61043 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NinQ61043 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NinQ61043 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NinQ61043 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NinQ61043 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NinQ61043 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NinQ61043 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NinQ61043 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NinQ61043 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NinQ61043 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NinQ61043 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NinQ61043 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NinQ61043 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NinQ61043 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NinQ61043 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NinQ61043 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NinQ61043 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NinQ61043 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NinQ61043 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NinQ61043 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NinQ61043 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NinQ61043 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NinQ61043 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NinQ61043 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NinQ61043 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NinQ61043 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NinQ61043 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NinQ61043 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NinQ61043 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NinQ61043 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NinQ61043 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NinQ61043 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NinQ61043 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NinQ61043 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NinQ61043 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NinQ61043 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NinQ61043 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NinQ61043 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NinQ61043 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NinQ61043 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NinQ61043 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms