Protein–RNA interactions for Protein: Q61033

Tmpo, Lamina-associated polypeptide 2, isoforms alpha/zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmpoQ61033 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TmpoQ61033 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TmpoQ61033 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TmpoQ61033 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TmpoQ61033 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TmpoQ61033 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TmpoQ61033 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TmpoQ61033 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TmpoQ61033 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TmpoQ61033 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TmpoQ61033 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms