Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms