Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1r1bQ60829 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp1r1bQ60829 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms