Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stxbp3Q60770 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms