Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csnk2a1Q60737 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csnk2a1Q60737 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csnk2a1Q60737 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csnk2a1Q60737 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk2a1Q60737 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk2a1Q60737 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk2a1Q60737 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk2a1Q60737 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk2a1Q60737 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk2a1Q60737 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk2a1Q60737 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk2a1Q60737 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk2a1Q60737 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk2a1Q60737 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk2a1Q60737 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk2a1Q60737 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk2a1Q60737 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk2a1Q60737 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk2a1Q60737 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csnk2a1Q60737 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csnk2a1Q60737 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Csnk2a1Q60737 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Csnk2a1Q60737 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Csnk2a1Q60737 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms