Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms