Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr2f1Q60632 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms