Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CttnQ60598 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CttnQ60598 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CttnQ60598 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CttnQ60598 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CttnQ60598 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CttnQ60598 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CttnQ60598 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CttnQ60598 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CttnQ60598 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CttnQ60598 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CttnQ60598 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CttnQ60598 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CttnQ60598 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms