Protein–RNA interactions for Protein: Q5U430

Ubr3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubr3Q5U430 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ubr3Q5U430 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubr3Q5U430 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubr3Q5U430 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubr3Q5U430 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubr3Q5U430 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubr3Q5U430 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubr3Q5U430 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubr3Q5U430 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubr3Q5U430 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubr3Q5U430 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubr3Q5U430 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubr3Q5U430 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubr3Q5U430 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubr3Q5U430 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubr3Q5U430 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubr3Q5U430 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubr3Q5U430 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubr3Q5U430 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubr3Q5U430 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubr3Q5U430 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubr3Q5U430 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubr3Q5U430 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubr3Q5U430 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubr3Q5U430 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubr3Q5U430 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubr3Q5U430 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubr3Q5U430 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubr3Q5U430 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubr3Q5U430 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubr3Q5U430 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubr3Q5U430 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubr3Q5U430 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubr3Q5U430 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubr3Q5U430 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubr3Q5U430 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubr3Q5U430 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubr3Q5U430 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubr3Q5U430 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubr3Q5U430 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubr3Q5U430 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubr3Q5U430 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubr3Q5U430 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubr3Q5U430 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms