Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Myh1Q5SX40 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Myh1Q5SX40 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Myh1Q5SX40 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms