Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVR0

Tbc1d9b, TBC1 domain family member 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d9bQ5SVR0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tbc1d9bQ5SVR0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tbc1d9bQ5SVR0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tbc1d9bQ5SVR0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tbc1d9bQ5SVR0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tbc1d9bQ5SVR0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tbc1d9bQ5SVR0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tbc1d9bQ5SVR0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tbc1d9bQ5SVR0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tbc1d9bQ5SVR0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d9bQ5SVR0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d9bQ5SVR0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d9bQ5SVR0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d9bQ5SVR0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d9bQ5SVR0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d9bQ5SVR0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d9bQ5SVR0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d9bQ5SVR0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d9bQ5SVR0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbc1d9bQ5SVR0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbc1d9bQ5SVR0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbc1d9bQ5SVR0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbc1d9bQ5SVR0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbc1d9bQ5SVR0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbc1d9bQ5SVR0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbc1d9bQ5SVR0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbc1d9bQ5SVR0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tbc1d9bQ5SVR0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tbc1d9bQ5SVR0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tbc1d9bQ5SVR0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tbc1d9bQ5SVR0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tbc1d9bQ5SVR0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tbc1d9bQ5SVR0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tbc1d9bQ5SVR0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tbc1d9bQ5SVR0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tbc1d9bQ5SVR0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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