Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms