Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ankrd40Q5SUE8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms