Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sco1Q5SUC9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms