Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSF7

Fam46c, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, mousemouse

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46cQ5SSF7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam46cQ5SSF7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam46cQ5SSF7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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