Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnf215Q5SPX3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf215Q5SPX3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf215Q5SPX3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf215Q5SPX3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf215Q5SPX3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf215Q5SPX3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf215Q5SPX3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf215Q5SPX3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf215Q5SPX3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf215Q5SPX3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf215Q5SPX3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf215Q5SPX3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rnf215Q5SPX3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms