Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtp3Q5QGU6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms