Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms