Protein–RNA interactions for Protein: Q5M8N4

Sdr39u1, Epimerase family protein SDR39U1, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr39u1Q5M8N4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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