Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms