Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Znf608Q56A10 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Znf608Q56A10 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Znf608Q56A10 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Znf608Q56A10 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Znf608Q56A10 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Znf608Q56A10 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Znf608Q56A10 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Znf608Q56A10 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Znf608Q56A10 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Znf608Q56A10 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Znf608Q56A10 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Znf608Q56A10 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Znf608Q56A10 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Znf608Q56A10 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Znf608Q56A10 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Znf608Q56A10 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Znf608Q56A10 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
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Znf608Q56A10 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Znf608Q56A10 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Znf608Q56A10 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Znf608Q56A10 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Znf608Q56A10 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Znf608Q56A10 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Znf608Q56A10 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Znf608Q56A10 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Znf608Q56A10 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Znf608Q56A10 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Znf608Q56A10 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Znf608Q56A10 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Znf608Q56A10 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Znf608Q56A10 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Znf608Q56A10 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Znf608Q56A10 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Znf608Q56A10 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Znf608Q56A10 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Znf608Q56A10 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Znf608Q56A10 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Znf608Q56A10 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Znf608Q56A10 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Znf608Q56A10 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Znf608Q56A10 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Znf608Q56A10 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Znf608Q56A10 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Znf608Q56A10 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Znf608Q56A10 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Znf608Q56A10 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Znf608Q56A10 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1095.9 ms