Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Eme2Q56A04 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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