Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccnl1Q52KE7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms