Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prpf38aQ4FK66 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms