Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Fam220aQ3ZN08 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam220aQ3ZN08 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam220aQ3ZN08 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam220aQ3ZN08 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam220aQ3ZN08 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Fam220aQ3ZN08 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Fam220aQ3ZN08 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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Fam220aQ3ZN08 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Fam220aQ3ZN08 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam220aQ3ZN08 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam220aQ3ZN08 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam220aQ3ZN08 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Fam220aQ3ZN08 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam220aQ3ZN08 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Fam220aQ3ZN08 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Fam220aQ3ZN08 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam220aQ3ZN08 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam220aQ3ZN08 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam220aQ3ZN08 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam220aQ3ZN08 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam220aQ3ZN08 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam220aQ3ZN08 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam220aQ3ZN08 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam220aQ3ZN08 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam220aQ3ZN08 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam220aQ3ZN08 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam220aQ3ZN08 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Fam220aQ3ZN08 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam220aQ3ZN08 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam220aQ3ZN08 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam220aQ3ZN08 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam220aQ3ZN08 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms