Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ulk4Q3V129 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ulk4Q3V129 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ulk4Q3V129 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ulk4Q3V129 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ulk4Q3V129 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ulk4Q3V129 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ulk4Q3V129 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ulk4Q3V129 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ulk4Q3V129 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ulk4Q3V129 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ulk4Q3V129 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ulk4Q3V129 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ulk4Q3V129 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ulk4Q3V129 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ulk4Q3V129 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ulk4Q3V129 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ulk4Q3V129 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ulk4Q3V129 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ulk4Q3V129 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ulk4Q3V129 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ulk4Q3V129 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ulk4Q3V129 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ulk4Q3V129 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ulk4Q3V129 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ulk4Q3V129 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ulk4Q3V129 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ulk4Q3V129 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ulk4Q3V129 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ulk4Q3V129 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ulk4Q3V129 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ulk4Q3V129 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ulk4Q3V129 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ulk4Q3V129 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ulk4Q3V129 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ulk4Q3V129 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ulk4Q3V129 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ulk4Q3V129 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ulk4Q3V129 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ulk4Q3V129 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms