Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms