Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc43Q3V0L5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
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