Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms