Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms