Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc114Q3UX62 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc114Q3UX62 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc114Q3UX62 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc114Q3UX62 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc114Q3UX62 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc114Q3UX62 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc114Q3UX62 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc114Q3UX62 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc114Q3UX62 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc114Q3UX62 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc114Q3UX62 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc114Q3UX62 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc114Q3UX62 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc114Q3UX62 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc114Q3UX62 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Ccdc114Q3UX62 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc114Q3UX62 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc114Q3UX62 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms