Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
E330034G19RikQ3UWX6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms