Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU41

Scimp, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScimpQ3UU41 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ScimpQ3UU41 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ScimpQ3UU41 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ScimpQ3UU41 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ScimpQ3UU41 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ScimpQ3UU41 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ScimpQ3UU41 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ScimpQ3UU41 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ScimpQ3UU41 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ScimpQ3UU41 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ScimpQ3UU41 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ScimpQ3UU41 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ScimpQ3UU41 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ScimpQ3UU41 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ScimpQ3UU41 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ScimpQ3UU41 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ScimpQ3UU41 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms