Protein–RNA interactions for Protein: Q3USY0

Slc38a11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a11Q3USY0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a11Q3USY0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms