Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm6899Q3USS0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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