Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fchsd2Q3USJ8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fchsd2Q3USJ8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fchsd2Q3USJ8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fchsd2Q3USJ8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fchsd2Q3USJ8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fchsd2Q3USJ8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fchsd2Q3USJ8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fchsd2Q3USJ8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fchsd2Q3USJ8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fchsd2Q3USJ8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fchsd2Q3USJ8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fchsd2Q3USJ8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fchsd2Q3USJ8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fchsd2Q3USJ8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fchsd2Q3USJ8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fchsd2Q3USJ8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Fchsd2Q3USJ8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fchsd2Q3USJ8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fchsd2Q3USJ8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fchsd2Q3USJ8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fchsd2Q3USJ8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fchsd2Q3USJ8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fchsd2Q3USJ8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fchsd2Q3USJ8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fchsd2Q3USJ8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fchsd2Q3USJ8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fchsd2Q3USJ8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Fchsd2Q3USJ8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Fchsd2Q3USJ8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fchsd2Q3USJ8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fchsd2Q3USJ8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Fchsd2Q3USJ8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms