Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms