Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQS8

Rbm20, RNA-binding protein 20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm20Q3UQS8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbm20Q3UQS8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbm20Q3UQS8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbm20Q3UQS8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbm20Q3UQS8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbm20Q3UQS8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbm20Q3UQS8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbm20Q3UQS8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rbm20Q3UQS8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms