Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms