Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcgf5Q3UK78 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms