Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJP5

Protein C8orf37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UJP5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3UJP5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3UJP5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3UJP5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3UJP5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3UJP5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3UJP5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3UJP5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3UJP5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3UJP5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3UJP5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3UJP5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3UJP5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3UJP5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3UJP5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3UJP5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3UJP5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3UJP5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3UJP5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3UJP5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3UJP5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3UJP5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3UJP5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3UJP5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3UJP5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3UJP5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3UJP5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3UJP5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3UJP5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3UJP5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3UJP5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3UJP5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3UJP5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3UJP5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3UJP5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3UJP5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3UJP5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3UJP5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3UJP5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q3UJP5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Q3UJP5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q3UJP5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q3UJP5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Q3UJP5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Q3UJP5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms