Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Usp19Q3UJD6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms